寛治4年（1090）白河上皇の護持僧であった増誉が熊野御幸の先達を務めた功績により賜った寺院で、日本初の修験道の総本山である。第4代住職として静恵法親王が入寺されてより門跡寺院となる。狩野派の絵師による襖や障壁画を多数所蔵し本尊不動明王や後水尾天皇作の書院等は重要文化財。光格天皇や孝明天皇が使用され「旧仮皇居」の史跡指定もされている。